Muniesa ha jugado en La Muela y el Ebrosala, el pívot llegó al equipo azulón en 2012 y ha sido una pieza fundamental en los éxitos más recientes del Colo, logrando tres Ligas de Segunda División ‘B’ y un ascenso a Segunda División.
El club ha compartido que Juan destaca por su “sacrificio sobre la pista y acierto de cara a portería”. Lo que le ha llevado a acumular un total de 47 goles en la categoría de plata del fútbol sala nacional. En la temporada 2018/2019 fueron 28 y se convirtió en el segundo máximo anotador de Segunda División. Por el contrario en la última temporada marcó 19 tantos.